癌症是对人类健康威胁最大的疾病之一。根据世界卫生组织(WHO)的统计,2018 年全球新发癌症病例达到 1,807 万例,其中肺癌 209 万例,发病率名lie前茅。
中国癌症新发患者人数也在逐年增加,根据国家癌症中心发布的全国癌症数据,2015 年全国新发恶性肿瘤病例数约 392.9 万例,肺癌位居发病shou位。
肺癌患病率逐年攀升,转移是肺癌高死亡率的主要原因之一,严重危害人类公共健康。
肺癌是如何转移的?
哪些因素会影响肺癌转移?
如何断了癌细胞后路,避免其转移?
这些问题一直困扰着研究人员。
近日,《Theranostics》上发表了一篇标题为:“Proteomic analysis of lung cancer cells reveals a critical role of BCAT1 in cancer cell metastasis"的论文,或许可以在一定程度上回答上述问题。
浓缩精华版:
研究人员发现:在转移性肺癌细胞和肺癌患者的转移性组织中,分支链氨基酸代谢的关键酶BCAT1蛋白水平呈现过表达状态。通过数据分析分析得出结论:BCAT1转录的增加,与肺癌患者总生存率较低之间存在关联性。
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在过去的十年中,基因组测序越来越多地被应用到转移性肿瘤突变谱的研究中 [1,2]。已有一些研究,对肺癌患者标本进行了全面的蛋白质基因组学研究,绘制了呈现了原发肿瘤相对于肿瘤旁“正常"组织的蛋白质组图 [3,4]。然而,关于转移性肺癌的蛋白质组水平的相关研究仍然不足。
我们已经知道,氨基酸代谢在肿瘤发生和转移中起重要作用。
氨基酸密码子对照表
支链氨基酸(BCAA)到α-酮戊二酸(α-KG)的转氨基反应,由胞质BCAT1和线粒体BCAT2两种类型的bcat基因催化。该反应产生谷氨酸,而谷氨酸又可以被肿瘤细胞优先利用以促进生存[5]。
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由此得到的支链酮酸(BCKA)进一步分解为乙酰辅酶A和琥珀酰辅酶A,它们是TCA循环的中间体[6]。BCAT1的过表达与髓样白血病[7]、胶质瘤[8]和非小细胞肺癌[9]的癌症进展有关,而增加BCAA摄取对于维持NSCLC[10]的肿瘤发生很重要。然而,BCAT1的表达过程,是否在转移性肿瘤中出现紊乱?在潜在的迁移过程中发挥作用?这些目前尚不清楚。
为了确定与肺癌转移状态相关的蛋白质组学的变化,研究人员用到了一种同位素标记(SILAC:细胞培养稳定同位素标记,在细胞培养过条件下,用含有轻、重同位素标记氨基酸的培养基,进行细胞培养,若干代后,细胞中的蛋白质被稳定标记上同位素)的定量质谱分析。
利用原发性肺腺癌A549细胞系(zhi定L0)和L0细胞进行了三轮BALB/c Nude小鼠体内选择,产生脊柱转移细胞(zhi 定L2和L6)[11]。然后,分别在“轻、中、重"三种同位素标记的培养基进行培养,稳定标记后进行质谱定量分析。
得到结果1
转移细胞显示出与原代细胞不同的蛋白质表达谱。相对于L0细胞,L6细胞中有74个蛋白、L2中有86个蛋白发生了显著变化。
在显著改变的蛋白质中,33个在两种转移细胞系(L2和L6)中出现重叠。
显著富集的通路是氨基酸代谢过程(1C-D)BCAT1, BCAA代谢速率限制酶,是转移细胞中最一致的上调蛋白。并且,上调蛋白的mRNA水平也升高。
随后,作者又比较分析了四对,来自肿瘤患者样本的原发和转移性肿瘤组织进行蛋白质组学。
采用串联质谱(TMT)标记和质谱定量分析方法检测蛋白表达,利用TCGA数据进行分析。
得到结果2
鉴定出14个变化显著的蛋白。其中大部分改变的蛋白参与免疫反应通路,包括干扰素- γ和PPAR信号通路。这些改变的蛋白也存在于先前SILAC质谱分析得到的数据库中。
患者的总生存期(OS, n = 241)与BCAT1表达呈负相关 ,表明,BCAT1可能是肺癌进展的一个弱预后标志物。
接着,研究人员利用A549细胞系,进行了一系列细胞学实验以及分子实验:Western blot、trans-well、RNA干扰等,以及小鼠体内实验,进一步探究BCAT1在转移中的作用。
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得到结果3
与使用原代和转移性A549细胞株的SILAC蛋白质组学结果一致,Western blot检测BCAT1发现在转移性细胞中显著增加。
L2和L6细胞的迁移能力明显高于原代L0细胞,说明转移性更高。
稳定表达shRNA对抗BCAT1 (shBCAT1)的L2和L6细胞,并进行了反转录实验。表达shBCAT1的细胞的迁移速度明显慢于表达重组shRNA的对照细胞。
体内实验发现:与对照组细胞相比,接种表达shBCAT1的L6细胞的小鼠的癌细胞转移率降低。
对主要转移部位(股骨和胫骨)的Micro-CT分析显示,接种转移细胞的小鼠有严重的骨性侵蚀(与L6和L0细胞相比),而接种表达shBCAT1的转移细胞的小鼠骨性侵蚀小得多。
最终得出结论:敲除BCAT1后,体外转移的L2和L6细胞迁移能力减弱,体内骨转移的严重程度大大降低,几乎达到L0水平。BCAT1的过表达可能驱动肺癌细胞转移,而降低BCAT1的表达抑制了癌细胞的迁移和转移。
为了深入了解BCAT1介导的转移的机制,研究人员检测了与干细胞和上皮-间质转化(EMT)相关基因的表达。
得到结果4
在L2和L6细胞中,干细胞转录因子SOX2在mRNA和蛋白水平均显著升高。
SOX2是维持胚胎干细胞和肿瘤干细胞可塑性的转录因子,它的过表达促进了肺癌的转移。在已有研究中,SOX2的表达增加可能会使L0细胞进入低分化状态,迁移能力增加。
文章作者从先前的研究[11]中重新分析了这些A549细胞的RNA-seq数据。
得到结果5
SOX2下游的许多基因在L2和L6细胞中均显著上调,包括Wnt信号基因NOTCH3、DVL1、DVL2和致癌基因KLF4。
与SOX2相互作用的转录因子,包括FOXK1和FOXC1,增加了表达。
显著富集的通路是氨基酸代谢过程(1C-D)BCAT1, BCAA代谢速率限制酶,是转移细胞中最一致的上调蛋白。并且,上调蛋白的mRNA水平也升高。
然而,在先前的SILAC实验结果中,转移细胞中包括CTNNB1和DVL2在内的Wnt信号蛋白减少。He等人之前的一项研究也表明,过表达SOX2可能通过上调A549细胞[12]中的GSK3β,导致Wnt/β-catenin信号通路的抑制。
因此,作者假设SOX2通过β-catenin抑制Wnt信号,维持转移细胞的未分化状态。
为了验证这一假设,研究人员用几种不同的方式:荧光成像、流式细胞术、Western blot、Real-time PCR,确定了BCAT1在转移性A549细胞中促进了SOX2的表达,这一新的途径可能是肺癌细胞干性的重要调控因子。
得到结果6
α-KG 水平确实在L2和L6细胞中降低,而降低BCAT1的表达部分恢复了α-KG 水平。
谷氨酸、KIV和BCAAs在转移细胞中积累。
随着降低BCAT1的表达,这些氨基酸和酮酸的水平也会降低。由于α-KG是DNA去甲基化酶TET2的辅助因子,降低α-KG浓度可能导致靶基因启动子区域的高甲基化,从而沉默这些基因。
检测了DNA甲基化,发现L2和L6细胞中5-甲基脱氧胞嘧啶(5mdC)显著升高,表明DNA有整体高甲基化的趋势。
在表达sh-BCAT1的L2和L6细胞中,5mdC大量减少。此外,在L2和L6细胞中观察到组蛋白甲基化增加的现象。
TET2调控的许多基因中有编码micro-RNAs的基因,已有研究表明miR200家族成员是SOX2的负调控因子。
这提出了一种可能性:
即bcat介导的α-KG的减少导致miR200家族成员的高甲基化,并解除了SOX2的翻译抑制。
分析显示miR200c的表达与BCAT1呈负相关。
有报道称:miR-200c表达的丢失在NSCLC中诱导了侵袭性表型。研究人员测量了miR200c,以及其他后续实验。
得到结果7
miR200c在L2和L6细胞中观察到统计学上显著的大幅减少。
敲除BCAT1可增加miR200c的表达。
另外两种可以靶向SOX2 mRNA的microRNA:miR429和miR21-5p,在BCAT1敲除后也表现出类似的效果,尽管它们在转移细胞中表达水平不同。
添加DM-α-KG(一种能够穿透细胞膜的α-KG类似物),可以在L2和L6细胞中以剂量依赖性的方式降低SOX2的表达。
DM-α-KG治疗也增加了转移细胞中的miR200c。
因此,研究人员认为:
BCAT1-α-KG-miR200c-SOX2
调控途径成立!
综上所述,研究发现BCAT1在转移性肺癌细胞中表达上调,调控其迁移转移,并与不良预后相关。该研究确定了一条新的通路,其中α-KG是转移性肺癌细胞中BCAT1和SOX2表达转录后调控之间的关键代谢信号传导中间体。
这些发现可能为靶向肺癌转移过程的治疗开辟新的策略。