PCR实验的污染来源都有哪些?
样本间交叉污染:收集样本的容器被污染或样本密封不严导致外溢;不同样本移液时忘记更换枪尖或未使用带滤芯枪尖;移液器等实验器具及耗材未及时消毒灭菌;不同样本同时开盖或样本剧烈震荡、反复吹吸导致气溶胶形成扩散,相互交叉污染。
实验试剂污染:主要是在 PCR 组分试剂加样过程中,由于移液器、容器、阴性对照及其它试剂被核酸模板或阳性对照污染。加样过程中,因为PCR试剂对温度十分敏感,需要通过冰浴使得PCR试剂和PCR板/管处于0℃,但这个过程也充满污染风险。
扩增产物污染:大量拷贝的产物泄漏或扩增后的PCR反应管意外开盖,这是PCR反应中最主要、最常见的污染问题。因为PCR产物拷贝量大,远远高于PCR检测数个拷贝的极限,所以极微量的PCR产物污染,就可形成假阳性。
那么对于【细胞和生物制品】及其生产过程中【支原体】污染的检测,有什么PCR检测方法吗?
常规PCR Kit (经典法)(不含Taq酶)
特点
1.内控对照为独立包装,遵循欧洲药典和日本药典操作流程。
2.高特异性,仅一条阳性对照条带,即可涵盖所有可能感染细胞的支原体物种。操作简单,
易于观察。
3. 高灵敏度,若PCR反应体系加入10μl样本,支原体检测限度为≤5或≤10CFU。
(详见下文“(2)Venor® Gem Classic Kit 10种常见支原体检测限“)
4.欧洲药典要求的26种支原体均可检出。该试剂盒可检测出1种脲原体、7种无胆甾原体和85种支原体,与细菌和真核DNA无交叉反应。
5.试剂盒中不含Taq酶,可另外购买。推荐使用德国MB公司专用Taq酶。(货号: 53-1050)
Venor® Gem Classic Kit
10种常见支原体检测限

操作步骤
第1步:样本处理
a. 细胞培养上清

b. 生物药或需遵循药典的样本
说明:①样品基质可能会影响检测的灵敏度。收集和筛选更高的样品量可提高测定灵敏度。
②细胞培养物样本含丰富的DNA酶,在低温下也能降解支原DNA,影响检测灵敏度。
建议:样本做DNA抽提处理,实现最高灵敏度。
推荐:德国MB公司生产的专用支原体DNA提取试剂盒,Venor® Gem Sample Preparation Kit。该DNA抽提试 剂盒已经过广泛验证。
第2步:试剂制备

第3步:PCR体系建立
a. 细胞培养上清

b. 生物药或需遵循药典的样本

第4步:启动PCR反应

第5步:电泳结果分析

191bp为内控对照条带,表明PCR反应正常。
当样本存在支原体污染时,由于内控对照与支原体DNA存在竞争,内控对照条带变弱(例如支原体DNA>103拷贝)。
阳性对照中支原体DNA>104拷贝,内控对照条带会*消失。
可能在80-90bp存在引物自退火形成的条带,此条带不影响检测结果。
如果待测样本对PCR产生抑制,则内控对照条带变弱(和阴性对照相比),此时应先进行DNA抽提(推荐使用:Venor® Gem Sample Preparation Kit 支原体DNA抽提试剂盒,详见第25页),然后再检测。

储存条件
2~8℃至少6个月。复溶后在-18℃保存。