PCR实验的污染来源都有:样本间交叉污染、实验试剂污染、扩增产物污染
防止实验污染都有哪些措施?
对于低流行地区,PCR检测人员经过严格培训上岗后,核酸污染的风险相对较小,但在疫区超负荷工作时,就可能会遇到核酸污染的问题,可通过以下措施降低污染机会:
正确佩戴手套:手套未紧密贴合拇指、食指和中指,在进行开盖操作时容易发生交叉污染。
正确使用生物安全柜:简单、整洁、避免通风口堵塞;操作前后紫外线照射,消毒剂随手可及;废液缸里有1/3体积的含氯消毒液,并且及时清理废液缸,保证废物不超过废液缸体积的2/3。
核酸提取仪去污染:每天多批次检测时,在每一批次检测完以后必须用75%的乙醇和核酸去除剂对仪器进行去污染。
重视通风:不定期对房间进行通风,每次至少持续30min。
PCR扩增区去污染:PCR反应管必须盖紧,避免扩增后的核酸对环境的污染。
实验室随手可及的消毒剂。
常规PCR Kit (经典法)(不含Taq酶)
特点
1.内控对照为独立包装,遵循欧洲药典和日本药典操作流程。
2.高特异性,仅一条阳性对照条带,即可涵盖所有可能感染细胞的支原体物种。操作简单,
易于观察。
3. 高灵敏度,若PCR反应体系加入10μl样本,支原体检测限度为≤5或≤10CFU。
(详见下文“(2)Venor® Gem Classic Kit 10种常见支原体检测限“)
4.欧洲药典要求的26种支原体均可检出。该试剂盒可检测出1种脲原体、7种无胆甾原体和85种支原体,与细菌和真核DNA无交叉反应。
5.试剂盒中不含Taq酶,可另外购买。推荐使用德国MB公司专用Taq酶。(货号: 53-1050)
Venor® Gem Classic Kit
10种常见支原体检测限

操作步骤
第1步:样本处理
a. 细胞培养上清

b. 生物药或需遵循药典的样本
说明:①样品基质可能会影响检测的灵敏度。收集和筛选更高的样品量可提高测定灵敏度。
②细胞培养物样本含丰富的DNA酶,在低温下也能降解支原DNA,影响检测灵敏度。
建议:样本做DNA抽提处理,实现最高灵敏度。
推荐:德国MB公司生产的专用支原体DNA提取试剂盒,Venor® Gem Sample Preparation Kit。该DNA抽提试 剂盒已经过广泛验证。
第2步:试剂制备

第3步:PCR体系建立
a. 细胞培养上清

b. 生物药或需遵循药典的样本

第4步:启动PCR反应

第5步:电泳结果分析

191bp为内控对照条带,表明PCR反应正常。
当样本存在支原体污染时,由于内控对照与支原体DNA存在竞争,内控对照条带变弱(例如支原体DNA>103拷贝)。
阳性对照中支原体DNA>104拷贝,内控对照条带会*消失。
可能在80-90bp存在引物自退火形成的条带,此条带不影响检测结果。
如果待测样本对PCR产生抑制,则内控对照条带变弱(和阴性对照相比),此时应先进行DNA抽提(推荐使用:Venor® Gem Sample Preparation Kit 支原体DNA抽提试剂盒,详见第25页),然后再检测。

储存条件
2~8℃至少6个月。复溶后在-18℃保存。