支原体qPCR法介绍:
荧光定量PCR法(qPCR):是在常规PCR基础上,将『针对支原体特异性保守序列的探针』做荧光标记,使PCR扩增后的产物带有荧光,利用荧光信号的变化和配套软件,进行DNA扩增反应的实时监测,简称qPCR。
优点:
①灵敏度高、特异性强。
②时间短,2-3小时出结果
③检测结果可定量
④操作简便
缺点:
①对于已做支原体灭活处理的样品,由于支原体DNA仍旧存在其中,PCR结果会出现假阳性。(可用培养法做补充验证)
②不同厂家生产的试剂盒质量差异巨大(由于引物及内在设计不同),需谨慎选择,尽量在专业人员推荐指导下使用。
操作步骤
第1步:样本处理
a.细胞培养上清
b. 生物药或需遵循药典的样本
说明:①样品基质可能会影响检测的灵敏度。收集和筛选更高的样品量可提高测定灵敏度。
②细胞培养物样本含丰富的DNA酶,在低温下也能降解支原DNA,影响检测灵敏度。
建议:样本做DNA抽提处理,实现最高灵敏度。
推荐:德国MB公司生产的专用支原体DNA提取试剂盒
Venor® Gem Sample Preparation Kit
该DNA抽提试剂盒已经过广泛验证。
第2步:试剂制备
a.冻干粉溶解
b. 反应体系制备
b1) 样品为细胞上清筛查——反应体系制备
b2) 样品为生物药——反应体系制备
第3步:启动荧光定量PCR仪
第4步:结果判别
FAM通道:检测支原体荧光信号。HEX通道:检测内控对照荧光信号。
支原体DNA和内控DNA存在信号的竞争性抑制。
支原体DNA越多,FAM通道信号越高,检测内控对照的HEX通道信号越低。
定量需基于Ct值和DNA标准曲线。
Ct<40为阳性结果。Ct≥40为阴性结果